昨年から、新しいデザインのCHiLO Bookを製作しています。
新デザインのCHiLO Bookでは各ページのタイトルなど、色々なところに手を加えていますが、大きな変更点としてはEPUB3リーダーに読ませる論理的な目次とHTMLでデザインした視覚的な目次を分けてEPUBに載せようとしている点があります。
（2種類の目次については、こちらのスライドが詳しいです EPUBのナビゲーションを理解しよう）
視覚的な目次は、論理的な目次のようなリストタグの階層構造に囚われずにデザインできますが、今のところCHiLO Producerでは出力できず、手作業で作っていく必要があります。今後、CHiLO ProducerでEPUBを作るうえでは工夫が必要そうです。
